おなかの中の赤ちゃんがトキソプラズマに感染したかどうか調べる方法はありますか？

母体で収まる場合もありますが、それは生まれてみないとはっきりはしません。
胎児が感染してしまったかどうかを調べるために、羊水を採取してPCR検査でトキソプラズマのゲノムを検出することもできますが、状況によっては羊水検査そのものができないこともあります。
感染してしまった場合、胎児エコー検査でもわかるもの（例えば、水頭症、小頭症、脳内石灰化、肝脾腫大、腹水など）もありますが、そのような形態異常以外はわかりません。
また、これらの所見がトキソプラズマとは別の理由で認められることもあるので、その判断はできません。
逆に感染していても何のエコー所見も認められないこともあります。
結局は、生まれてみないとはっきりしないのです。